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Accueil > FR > Recherche > Dynamique non linéaire des Systèmes Optiques et Biologiques > Systèmes Biologiques > Horloges Circadiennes

Modélisation des horloges biologiques

par Benjamin PFEUTY, Marc LEFRANC, Quentin THOMMEN - publié le , mis à jour le

En collaboration étroite avec des biologistes de l’observatoire océanologique de Banyuls (algue microscopique Ostreococcus tauri) et de l’Institut Pasteur de Lille (souris, homme), nous cherchons à établir des modèles mathématiques qui rendent fidèlement compte des observations expérimentales et des profils temporels observés. Nous utilisons ces modèles afin d’identifier les principes architecturaux qui confèrent aux horloges circadiennes les propriétés qu’exigent leur fonction : régularité, robustesse, flexibilité.

Pour une présentation générale sur les horloges circadiennes, voir ici...

Nos activités se concentrent sur deux problématiques :

À court ou moyen terme, nous espérons pouvoir rendre compte des interactions de l’horloge circadienne avec d’autres aspects de la dynamique cellulaire, et notamment le cycle de division, le métabolisme, et la réponse au stress.
Ainsi, nous visons l’identification et la compréhension des principes permettant l’intégration harmonieuse des différentes fonctions cellulaires.

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Publications

- [1] Robustness of circadian clocks to daylight fluctuations : hints from the picoeucaryote Ostreococcus tauri. PLoS Comput. Biol., 6:e1000990 (2010)
- [2] A robust two-gene oscillator at the core of Ostreococcus tauri circadian clock. Chaos, 20:045108 (2010)
- [3] Robust entrainment of circadian oscillators requires specific phase response curves. Biophys J, 100:2557-67 (2011)
- [4] Robust and flexible response of Ostreococcus tauri circadian clock to light/dark cycles of varying photoperiod. FEBS J. (2012)
- [5] Circadian clocks in changing weather and seasons : lessons from the microscopic algae Ostreococcus tauri. BioEssays, 34:781-90 (2012)
- [6] Transcriptional versus non-transcriptional clocks : A case study in Ostreococcus. Marine Genomics 14:17-22 (2014)
- [7] Probing entrainment of Ostreococcus tauri circadian clock by green and blue light through a mathematical modeling approach. Frontiers in genetics (accepté)